日本农协又称为“农民协同组织”，指的是农民作为其中主要的参与者，在农业各生产、生活领域相互协作而组成的经济组织，该组织对农村农业的发展进步和农民生活质量的提升起到了非常积极的作用。
东方国家比如中国、日本、韩国等都是资源匮乏并且人口密度较大的国家，也都是以发展小农产业和家庭手工业为主。由于小规模农业抗风险能力较差，并且很难与市场接轨，因此进行规模而有效的发展对于农民增产增收来说十分重要。为了克服小规模农业的弊端，日本农民就想通过形成组织来保护自己，所以日本农协应运而生。该组织没有改变小规模经营的模式，但是形成了一定的组织来顺应市场发展。半个世纪以来，日本农协的组织形式和业务机制都得到了国际专家和学者高度的一致认同，其综合职能大致可以概括为以下四个。
（1）综合指导职能。指导农民生产和生活属于日本农协最主要的职能。日本农协生产上的指导包括粮食作物和蔬菜水果等的种植栽培、畜牧业的发展、机械使用的指导等。由于时代的发展和国民素质的提高，农民对城市生活方式以及高质量生活的憧憬越来越强烈，因此日本农协需要指导农户的生活。在农村建设一些城市的基础设施来方便农村百姓，很大程度上给予了他们生活上的舒适和便捷，从而大大提高日本农民农业生产的积极性和效率。
（2）集中供销职能。在购买方面，日本农协统一批发购置，帮助了农民们购买这些资料，大大降低了农民购买成本，并且派专业人员进行监督检查，确保了产品质量和安全。日本农协还开设农业超市服务于民，农民可以在农协专属超市购买所需要的商品。在销售方面，日本农协为农户代销农产品，帮助农民在市场上谋求合理的价格，并且在各个地区开设农产品销售点，便利各地的农户。
（3）信用互助职能。农民融资难、贷款难的问题一直困扰着各国政府，但日本市町级农协可以给农民提供更优惠的储蓄和贷款业务。市町级农协有着高于银行存款利率0.1%的储蓄业务和低于银行贷款利率0.1%的贷款业务，极大地受益当地农民。由于市町级农协是综合性的农协，兼有购买销售等职能，因此农民在农协可以用信用享受这一条龙的服务。农协也会将这些职能统一核算，将农民的购买销售等变得更加便利。日本农协不仅有日本政府进行担保，也受到诸如监事会等一些行政机关的检查，因此日本农民十分信赖农协的金融服务，愿意去农协储蓄和借贷。
（4）厚生共济职能。厚生共济职能指的是日本农协对日本农民提供一系列社会保障和社会保险的服务。虽然该职能出现的比较晚，但由于社会强烈的需要，促使发展十分迅速，逐渐成为日本农协重要的职能之一。日本农协短期保险包括火灾保险、汽车保险、人身保险等，长期保险包括人身保险、财产保险等。同时日本农协成立了自己本身的医疗所，派遣流动医生到每个市町村去诊查病人。由于日本老龄化的日趋严重，日本农协的老人服务也做的越来越贴心周到。家人可以将老人送入日本农协和其他老人一起休闲娱乐，日本农协也会派人去老人家里照顾老人。日本农协对老人提供的优质服务大大减轻了想外出务工年轻人照顾家中老人的负担。
我国和日本有着相同的东方文化背景，东方文化背景下日本农协的综合职能模式对我国合作社的发展具有更独特的可借鉴性
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